Признаки метилирования ДНК грудного вскармливания в буккальных клетках, собранные в середине детства

Discussion of articles on nutrition and dietetics of both the yellow and the serious press

Модераторы: Симоненко Ольга, Натали

Аватара пользователя
Робот
VIP
VIP
Сообщения: 9594
Зарегистрирован: 11 июн 2018, 14:51
Поблагодарили: 2 раза

Признаки метилирования ДНК грудного вскармливания в буккальных клетках, собранные в середине детства

Непрочитанное сообщение Робот »

Nutrients, Vol. 11, Pages 2804: DNA Methylation Signatures of Breastfeeding in Buccal Cells Collected in Mid-Childhood

Nutrients doi: 10.3390/nu11112804

Authors: Veronika V. Odintsova Fiona A. Hagenbeek Matthew Suderman Doretta Caramaschi Catharina E. M. van Beijsterveldt Noah A. Kallsen Erik A. Ehli Gareth E. Davies Gennady T. Sukhikh Vassilios Fanos Caroline Relton Meike Bartels Dorret I. Boomsma Jenny van Dongen

Breastfeeding has long-term benefits for children that may be mediated via the epigenome. This pathway has been hypothesized, but the number of empirical studies in humans is small and mostly done by using peripheral blood as the DNA source. We performed an epigenome-wide association study (EWAS) in buccal cells collected around age nine (mean = 9.5) from 1006 twins recruited by the Netherlands Twin Register (NTR). An age-stratified analysis examined if effects attenuate with age (median split at 10 years; n<10 = 517, mean age = 7.9; n>10 = 489, mean age = 11.2). We performed replication analyses in two independent cohorts from the NTR (buccal cells) and the Avon Longitudinal Study of Parents and Children (ALSPAC) (peripheral blood), and we tested loci previously associated with breastfeeding in epigenetic studies. Genome-wide DNA methylation was assessed with the Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip (Illumina, San Diego, CA, USA) in the NTR and with the HumanMethylation450 Bead Chip in the ALSPAC. The duration of breastfeeding was dichotomized (&lsquo;never&lsquo; vs. &lsquo;ever&rsquo;). In the total sample, no robustly associated epigenome-wide significant CpGs were identified (&alpha; = 6.34 &times; 10&ndash;8). In the sub-group of children younger than 10 years, four significant CpGs were associated with breastfeeding after adjusting for child and maternal characteristics. In children older than 10 years, methylation differences at these CpGs were smaller and non-significant. The findings did not replicate in the NTR sample (n = 98; mean age = 7.5 years), and no nearby sites were associated with breastfeeding in the ALSPAC study (n = 938; mean age = 7.4). Of the CpG sites previously reported in the literature, three were associated with breastfeeding in children younger than 10 years, thus showing that these CpGs are associated with breastfeeding in buccal and blood cells. Our study is the first to show that breastfeeding is associated with epigenetic variation in buccal cells in children. Further studies are needed to investigate if methylation differences at these loci are caused by breastfeeding or by other unmeasured confounders, as well as what mechanism drives changes in associations with age.


Источник: https://www.mdpi.com/2072-6643/11/11/2804
Это сообщение оставлено Роботом
Аватара пользователя
Натали
Донатор
Донатор
Сообщения: 1328
Зарегистрирован: 21 авг 2018, 20:57
Откуда: Королёв
Благодарил (а): 72 раза
Поблагодарили: 36 раз

Re: Признаки метилирования ДНК грудного вскармливания в буккальных клетках, собранные в середине детства

Непрочитанное сообщение Натали »

Грудное вскармливание имеет долгосрочные преимущества для детей, которые могут быть опосредованы через эпигеном. Этот путь был предположен, но количество эмпирических исследований у людей невелико и в основном делается с использованием периферической крови в качестве источника ДНК. Мы провели исследование эпигеномной ассоциации (EWAS) в буккальных клетках, собранных в возрасте около девяти лет (среднее значение = 9,5) из 1006 близнецов, завербованных нидерландским регистром Близнецов (NTR).

Стратифицированный по возрасту анализ изучал, ослабляются ли эффекты с возрастом (медиана разбиения на 10 лет; n< 10 = 517, средний возраст = 7,9;n> 10 = 489, средний возраст = 11,2). Мы провели анализ репликации в двух независимых когортах из НТР (буккальные клетки) и продольного исследования Avon родителей и детей (ALSPAC) (периферическая кровь), и мы протестировали локусы, ранее связанные с грудным вскармливанием в эпигенетических исследованиях. Метилирование ДНК в широком геноме оценивали с помощью чипа Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip (Illumina, San Diego, CA, USA)в НТР и с помощью чипа Humanmethylation450 в ALSPAC. Продолжительность грудного вскармливания была дихотомии.

В общей выборке не было выявлено достоверно ассоциированных эпигеномных значимых CpGs (&alpha; = 6,34 &times; 10&ndash; 8). В подгруппе детей младше 10 лет четыре значимые СПГ были связаны с грудным вскармливанием после корректировки на характеристики ребенка и матери. У детей старше 10 лет различия в метилировании на этих CpGs были меньшими и несущественными. Полученные результаты не повторялись в выборке НТР (n = 98; средний возраст = 7,5 лет), и в исследовании ALSPAC не было выявлено ни одного близкого участка, связанного с грудным вскармливанием (n = 938; средний возраст = 7,4 года).

Из сайтов CpG, ранее описанных в литературе, три были связаны с грудным вскармливанием у детей младше 10 лет, что свидетельствует о том, что эти CpG связаны с грудным вскармливанием в буккальных и кровяных клетках. В нашем исследовании впервые показано, что грудное вскармливание связано с эпигенетической изменчивостью буккальных клеток у детей.

Необходимы дальнейшие исследования, чтобы выяснить, вызваны ли различия в метилировании в этих локусах грудным вскармливанием или другими неизмеряемыми путаницами, а также каким механизмом обусловлены изменения ассоциаций с возрастом.
Donat
Ответить
  • Похожие темы
    Ответы
    Просмотры
    Последнее сообщение
Всего 3 посетителя :: 2 зарегистрированных, 0 скрытых и 1 гость

Больше всего посетителей (147) здесь было 01 дек 2019, 18:14

Сейчас этот форум просматривают: Ahrefs [Bot], Bing [Bot] и 1 гость